酶活力和比活力的区别

         酶学评价需区分两项核心指标:酶活力(Activity)与比活力(Specific activity)。前者表征在既定测试条件下的总体催化速率,后者为单位蛋白质量对应的活力,用于反映纯度与单位蛋白的催化效率。仅在明确温度、pH/缓冲体系、底物与浓度、辅因子及初速区间的前提下,二者方可实现有效比较与溯源。

一、核心概念与单位

  • 酶活力(Activity):在既定测试条件下(温度、pH、底物、辅因子等),样品单位时间催化反应的总速率。常用单位U(1 U = 1 μmol·min⁻¹)或katal(1 kat = 1 mol·s⁻¹ = 6×10⁷ U)。
  • 比活力(Specific activity):单位蛋白质量所具有的酶活力,用U·mg⁻¹(或kat·kg⁻¹)表示,用于评价纯度与批间一致性。

维度

酶活力(Activity)

比活力(Specific activity)

定义

在规定条件下,样品单位时间催化的底物转化/产物生成速率的总量

在相同条件下,单位蛋白质量所具有的酶活力

反映

样品总体催化能力与回收量

样品中酶的纯度与单位蛋白的催化效率

与样品量关系

随酶含量线性增加(加倍样品,活力近似加倍)

与样品量无关,但依赖测定条件与杂蛋白比例

主要影响因素

酶浓度、温度、pH、底物浓度(是否近饱和)、离子/辅因子、抑制剂/激活剂、基质干扰

酶的固有性质(纯度、构象/装配)、同上所有测定条件

纯化/放大中的用途

计算回收率:每一步还剩多少总活性

计算纯化倍数:纯度/单位蛋白效率提高了多少倍

报告要点

必须注明:温度、pH/缓冲体系、底物与浓度、离子/辅因子、检测方式与波长、线性区间

同左,并明确蛋白定量方法(BCA/Bradford/UV280)与空白/干扰处理

计算公式

总活力:A_tot(U)=A_v(U·mL^-1)×V(mL)

比活力:SA(U·mg^-1)=A_tot(U)/蛋白质总量(mg)

常见误区

仅报U而不写条件;用非初速数据

把U·mg⁻¹当作kcat;不同条件下直接比对

二、测定与计算流程

1.实验步骤

1) 设定条件:温度(如25/30/37°C)、pH/缓冲体系、底物浓度(是否接近饱和)、金属离子/辅因子。

2) 定量方法:分光/荧光/pH-Stat/电极/色原底物;建立标准曲线(R²≥0.99)。

3) 初速区间:采集线性初速数据(底物未耗竭;产物/抑制剂未积累)。

4) 对照设置:无酶/灭活酶、无底物空白。

5) 计算活力:速率(μmol/min)→体积活力(U/mL)→总活力(U)。

6) 蛋白定量:BCA/Bradford/UV280(注明标准品与可能干扰并进行空白校正)。

7) 计算比活力:U/mg。


2. 术语与单位

酶活力:Enzyme activity(U、katal)

比活力:Specific activity(U/mg;kat/kg)

回收率:Activity recovery(%)

纯化倍数:Purification fold(×)

初速:Initial rate(v₀)

周转数:Turnover number(kcat, s⁻¹)

催化效率:kcat/Km(M⁻¹·s⁻¹)


3.关键公式

总活力(U)=体积活力(U/mL)×总体积(mL)

比活力(U/mg)=总活力(U)/总蛋白(mg)

回收率(%)=(该步总活力/粗提总活力)×100%

纯化倍数(fold)=该步比活力/粗提比活力


三、与动力学参数的边界

  • 比活力(U·mg⁻¹)≠kcat(s⁻¹)。比活力受总蛋白含量与测定条件影响;kcat依赖活性位点的有效摩尔浓度。
  • kcat/Km为二阶速率常数(M⁻¹·s⁻¹),描述稀底物条件下的本征效率;与比活力不在同一维度。

在已知分子量M(g·mol⁻¹)与活性位点占比f(0–1)时的换算:

  • SA(U·mg⁻¹)=(60,000×f/M)×kcat(s⁻¹)
  • kcat(s⁻¹)=SA(U·mg⁻¹)×M/(60,000×f)
  • 摩尔活性(U·µmol⁻¹)≈kcat(s⁻¹)×60(当f≈1时)

若未知f(部分失活/错误折叠/不完全装配),切勿由U·mg⁻¹直接推kcat。


四、实际应用实例

示例:某酶分子量M=50,000 g·mol⁻¹,样品测得SA=120 U·mg⁻¹,假设f=1。

  • 估算kcat:kcat=SA×M/(60,000×f)=120×50,000/60,000≈100s⁻¹。
  • 若该步总蛋白5 mg、总体积10 mL、体积活力测得60 U·mL⁻¹:
  • 总活力A_tot=60×10=600U;
  • 比活力SA=600U/5mg=120U·mg⁻¹(与上相符);
  • 若粗提步SA_crude=12U·mg⁻¹、A_tot_crude=1500U:
  • 纯化倍数=120/12=10×;
  • 回收率=600/1500×100%=40%

五、常见误区

1.把比活力当活力(或反之):前者单位U/mg,后者U或U/mL。

2.未报测定条件:温度/pH/底物/波长/离子/辅因子缺失→数据不可比。

3.蛋白定量被化学品干扰:

  • Bradford受去垢剂/高盐/甘油影响;BCA受DTT/β-ME影响。
  • 解决:透析/稀释、选兼容方法、做试剂空白校正与方法学对比。

4.非初速数据:底物耗竭或产物抑制→活力被低估。

5.体积/稀释记录不全:导致总活力与回收率计算错误。

6.跨批比较无标准化:不同天/不同批次需复用同一标准曲线与对照样。


六、速查清单

  • 单位:1 U=1 μmol/min;1 kat=1 mol/s=6×10^7U
  • 区分:活力看总产能;比活力看单位蛋白效率/纯度
  • 四步算清楚:体积活力→总活力→比活力→回收率/纯化倍数
  • 三件最重要:初速数据、标准曲线、完整测定条件
  • 对比时:条件一致+同批对照+记录齐全

七、干扰与规避

场景

可能干扰

影响方法

建议与规避

DTT/β-ME/TCEP

还原剂还原Cu²⁺

BCA偏高

透析/稀释;做试剂空白;改用Bradford/UV280(或用抗还原剂BCA方案)

含去垢剂(SDS/Triton/Tween

与染料/蛋白相互作用

Bradford偏差

选兼容试剂盒;样品去盐/稀释;改用BCA/UV280

甘油/高盐

折射率/黏度效应

Bradford/BCA/UV280

稀释到兼容范围;基质匹配的标准曲线

样品浑浊/色素

背景吸光/散射

分光法

设背景对照并扣除;必要时改用荧光/电极法

高核酸/核黄素

280 nm吸收

UV280

A260/A280判别;核酸去除或沉淀/超滤;序列计算ε(280)校正

微孔板读数

有效光程不明

分光法

启用路径校正(厂商算法或水在977 nm参考);注明孔体积与边缘效应控制

         结果报告与放大评估建议遵循“四步链”:体积活力→总活力→比活力→回收率/纯化倍数;严格以初速区间数据为依据,配套标准曲线(R²≥0.99)与方法学空白/干扰校正;跨批比较须保持测试条件一致并记录完整。需特别避免将U·mg⁻¹等同于kcat(s⁻¹),并在必要时区分kcat、kcat/Km与比活力的不同维度与适用范围。

 

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